Anders als bei der konventionellen IVF werden bei der ICSI-Methode die Eizellen vor der Mikromanipulation von ihren umgebenden Cumulus-Corona-Zellen befreit. So ist es möglich den Reifegrad und die morphologischen Eigenschaften der Eizellen mit Hilfe eines Mikroskops zu bewerten. Bei der ICSI Methode werden ausschließlich die reifen Eizellen behandelt. Hierbei wird eine Eizelle nach der anderen mit Hilfe einer Haltepipette fixiert und mittels einer Injektionspipette ein ausgesuchtes Spermium in die Eizelle hineingebracht. 17 bis 20 h nach der ICSI werden die Eizellen auf das Vorhandensein von Befruchtungsanzeichen untersucht.